国际研究生院的校园坐落在风景优美的深圳市南山区西丽湖畔，由原深圳大学城清华大学深圳研究生院校区（约21万平方米）、国际研究生院新校区一期（约12万平方米，计划于2021年投入使用），以及规划中的西丽湖地块和同富裕工业城地块组成。按照大湾区“科教高地”发展规划，西丽湖片区是科技创新走廊的主要战略节点，定位为西丽湖国际科教城；同时，如玉带般从校园中蜿蜒而过的大沙河将建成深圳的“塞纳河”。国际研究生院位于西丽湖“科教生态环”和大沙河“大学智慧带”上，将传承和延续清华的百年文化，融入本土的自然和人文环境，打造创新型、国际化、无边界的新型校园，塑造独特的校园文化。